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Pour des diagnostics plus rapides, moins chers et de meilleure qualite

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Des chercheurs torontois ont elabore un nouveau procede permettant de
realiser des traitements de donnees genetiques et proteiniques plus
precis
et pouvant mener a une meilleure comprehension du genome humain.
Le Docteur Christopher Hogue, principal investigateur de l’Initiative
Blueprint et son equipe de recherche du Toronto’s Mount Sinai Hospital
ont
travaille en collaboration avec les chercheurs du Departement de genie
electrique et informatique de l’Universite de Toronto. De cette
association
est ne le Field-Programmable Gate Arrays (FPGAs) destine a remplacer
les
lourds composants informatiques permettant le traitement de donnees
genetiques. Le FPGAs est un dispositif qui permet de realiser certaines
taches specifiques de facon plus rapide et efficace que le ferait un
ordinateur normal. La premiere utilisation commerciale du systeme sera
dans
le cadre d’analyses d’echantillons sanguin par spectrometrie de masse.
Jusqu’alors chaque analyse de sang etait soumise a un test specifique.
La
spectrometrie de masse permet l’obtention d’analyses beaucoup plus
larges et
diversifiees a partir d’un seul echantillon. Toutefois, cette methode
n’etait pas employee car elle generait beaucoup trop de donnees, de ce
fait
difficilement exploitables. Integrer le FPGAs au spectrometre de masse
permettra de contourner ce probleme.
Par ailleurs, l’Initiative Blueprint envisage, a terme, l’utilisation
du
FPGAs pour compiler les donnees genetiques et proteiniques, les
analyser et
simuler le comportement des cellules humaines. Cela devrait permettre
aux
scientifiques de mieux comprendre les interactions entre proteines. A
partir
des resultats obtenus, les industries pharmaceutiques pourront
developper
des medicaments plus sains et efficaces.

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